Naturværket rådgiver indenfor forvaltning af natur i forhold til de mål, der måtte være knyttet til gældende drifts- eller plejeplan. Forvaltningen vil desuden være målrettet mod en generel forbedring af biodiversiteten på arealet og understøtte nationale eller kommunale retningslinjer for området.
Såfremt der ikke er udarbejdet en drifts– eller plejeplan for området, så udarbejder Naturværket også gerne dette.
Naturværket vil lægge vægt på, at naturforvaltningen sker på en måde, så den er nem at implementere i en daglig drift, og at den sker på en måde, som kan understøtte udvikling af naturpleje som driftsgren og dermed lokalområdets udvikling.